Ich bin ehrlich gesagt etwas überfragt wie dieser Bug zustande kommt. Der taucht zwar nicht das erste Mal auf, hat sich aber für mich lösen lassen. Im Fall mit und ohne Mods treten keine Probleme auf, weder wenn ich ein neues Spiel starte, noch wenn ich einen Spielstand lade.
In welcher Factorio Version haben Sie das getestet?